1991年,香港黑帮龙头倪坤被杀,倪氏家族旗下五大头目中除韩琛(曾志伟)外,均伺机背叛发难,不料却被倪家不起眼的第二代倪永孝(吴镇宇)不费一兵一卒牵制,此举引来重案祖督察()黄志诚(黄秋生)的戒()心,使其派出警校学生()陈永仁(余文()乐())渗入()倪家进行长期的卧底工作,而韩琛为了巩固势力,早在警察内部安插了()线人刘()建明(陈冠希)。三年后,事业蒸蒸日上的()倪永孝为安枕无忧,决意将()五大头目一举歼灭,却因疏忽让韩琛成为漏网之鱼。
1997年,大难不死的韩琛重出江湖,为替死去的同事报()仇,黄志诚找到他商议合作除掉倪永孝的事宜(),不久却发现此举铸成大错,而各自为自己的尴()尬身份苦恼的陈永仁和刘建明,则在无间道的路上越行越远()。